Las características del relieve de la región con una red de drenaje pobremente definida, sumada en las tres décadas pasadas (1970 a 2000) a un importante aumento de las precipitaciones (que llegó a duplicar los promedios anuales), dio lugar a 10 picos de inundación.
 Los registros climáticos zonales indican la recurrencia histórica de ciclos húmedos de larga duración (50 años o más), que se alternan con períodos secos.
Esto impacta negativamente en el sector rural: poblaciones, infraestructura, economía y empleos zonales.
El partido de General Alvear se ubica en la región hídrica de la cuenca del Río Salado, y más específicamente, en la unidad geomorfológica denominada Zona Deprimida del Río Salado, los suelos presentan una gran heterogeneidad edáfica, en las áreas bajas resultan predominantes las tierras sujetas a procesos hidromórficos, alcalinos y salinos, con contenido de minerales arcillosos.
Los suelos están representados en mayor medida por Argiudoles y Natracuoles, en amplias planicies con muy baja pendiente, típicos suelos de la cuenca del Río Salado, con presencia de B2t y/o tosca muy próximo a la superficie, y en menor grado por Hapludoles en planicies arenosas con abundantes microcubetas. La principal limitante de estos suelos es la frecuencia de anegamientos ya sea por su escasa infiltración (en el caso de Argiudoles y Natracuoles) y lento escurrimiento.
Es una zona de baja altitud (40 metros sobre el nivel del mar).
El partido cuenta con tres arroyos: Vallimanca, Las Flores y Tapalqué y numerosos espejos lacustres.
Sus condiciones de borde hidráulicas están dadas al N.O. por el Arroyo Las Flores, al este por el Canal El Tabaré y los canales San Antonio y San Miguel, al sur por el Arroyo Tapalqué y al oeste por el Arroyo Vallimanca y el Canal N° 16.
La mayor afectación en superficies es producida por las aguas de escorrentía que provienen de los arroyos naturales Vallimanca, Tapalqué y Las Flores, situación que se agrava con las altas precipitaciones acaecidas a lo largo del año, las cuales provocan el desborde de dichos arroyos, lo mismo ocurre con el Canal Piñeyro (canal que lleva las aguas del Arroyo Tapalqué hacia el Arroyo Las Flores).
En síntesis sucede lo siguiente: cuando llega una onda crecida por el Arroyo Tapalqué y el Arroyo Vallimanca (los cuales traen agua desde el partido de Olavarría) y el Arroyo las Flores (que proviene de la Laguna Blanca Grande), se inunda el sector de influencia de éstos y de sus canales aliviadores de agua que surcan el partido (Canal Piñeyro, Canal N°16 , Canal San Antonio, etc..), esto se suma a la escasa pendiente e infiltración debido al tipo de suelo predominante, lo cual genera frecuentes inundaciones con muy lento escurrimiento.
En abril de 1988 comienza la construcción de la Defensa contra las Inundaciones en la Planta Urbana, terraplén en la periferia de la ciudad que servirá como muro de contención ante posibles inundaciones. Trabajan en esta obra máquinas cedidas por Vialidad y por Hidráulica.
En febrero de 1993 comienza la construcción de dos alcantarillas puente en el Acceso Noguera a la altura de la laguna La Espadaña.
En marzo de 1993 comienzan los trabajos en la obra de canalización del Arroyo Las Flores entre la Laguna San Vicente y el Puente de la Ruta 61, que implica un movimiento de tierra de 180.000 m3.
Con maquinarias municipales es levantado a partir de abril de 1993 el nivel de la antigua ruta 205 en Santa Isabel a fin de dar a los pobladores de este paraje una salida segura frente a las crecidas del arroyo Vallimanca.
En junio de 1993 se realiza una evaluación de los daños causados por la inundación en nuestro partido y gran parte de la cuenca del Salado. En General Alvear, en los seis primeros meses del año se produjeron lluvias equivalentes al régimen de todo el año, y si bien el campo se ve afectado en casi un 85%, la ciudad se benefició con la Defensa construída.
DEFENSA CONTRA LAS INUNDACIONES: Las obras comenzaron en 1988.
Tiene una longitud de 11.400 metros con un ancho de coronamiento de 6 metros y demandó un movimiento de tierra de 190.000 m3 en un talud de + 1:1,5.
Rodea toda la zona urbana protegiéndola de las inundaciones.